На главную

Протеомы

Сравнение протеомов Klebsiella oxytoca и Escherichia coli

При анализе частоты встречаемости различных аминокислотных остатков в протеомах Klebsiella oxytoca и Escherichia coli были получены следующие данные:

Таблица1. Сравнение протеомов по аминокислотным остаткам

Таблица2. Сводная: cравнение протеомов
Название организма Идентификатор протеома Число последовательностей в протеоме Число остатков в протеоме
Escherichia coli K12 UP000000625 4306 1356086
Klebsiella oxytoca E718 UP000003127 5975 1811882

Четыре наиболее часто встречающиеся аминокислоты (L, A, G, V в порядке убывания частоты),
а также шесть наиболее редко встречающихся аминокислот (V, C, W, H, M, Y в порядке возрастания частоты)
идут в полученных файлах в одинаковом порядке по частоте.

Разница во встречаемости для аминокислот в протеомах Klebsiella oxytoca и Escherichia coli самая большая по абсолютной величине у аланина.
Который встречается в протеоме Klebsiella oxytoca на 55825 больше раз, чем у Escherichia coli.


© Посицельская Екатерина, 2015