При анализе частоты встречаемости различных аминокислотных остатков в протеомах Klebsiella oxytoca и Escherichia coli были получены следующие данные:
Таблица1. Сравнение протеомов по аминокислотным остаткам
Таблица2. Сводная: cравнение протеомов | |||
Название организма | Идентификатор протеома | Число последовательностей в протеоме | Число остатков в протеоме |
Escherichia coli K12 | UP000000625 | 4306 | 1356086 |
Klebsiella oxytoca E718 | UP000003127 | 5975 | 1811882 |
Четыре наиболее часто встречающиеся аминокислоты (L, A, G, V в порядке убывания частоты),
а также шесть наиболее редко встречающихся аминокислот (V, C, W, H, M, Y в порядке возрастания частоты)
идут в полученных файлах в одинаковом порядке по частоте.
Разница во встречаемости для аминокислот в протеомах Klebsiella oxytoca и Escherichia coli самая большая
по абсолютной величине у аланина.
Который встречается в протеоме Klebsiella oxytoca на 55825 больше раз, чем у Escherichia coli.