Задание №1

Чтобы не дублировать записи, посмотрите второе задание здесь

Задание №2

Данные по кристаллографической ячейке из PDB файла:

CRYST1 68.627 73.662 106.368 (значения длин сторон) 90.00 90.00 90.00 (углы) [P (примитивная) 21 (порядок поворотной оси) 21 (обозначение винтовой оси) 21 4 - порядок симметрии] [о симметрии]


Задание №3

Одиночная молекула внутри решетки

Молекулы, расстояние до которых меньше 5 ангстрем. Их 8.

Выделение всех атомов приводит к данному интересному графическому эффекту

При выделении всех молекул, расстояние до которых меньше 40 ангстрем, действительно возникает ощущение симметрии


Задание №4

Файл структурных факторов
В дополнение к информации для задания №4 выкладываю также повтор информации для задания №2
#
_entry.id r3c7fsf
#
#
_cell.entry_id r3c7fsf
_cell.length_a 68.6270
_cell.length_b 73.6620
_cell.length_c 106.3680
_cell.angle_alpha 90.0000
_cell.angle_beta 90.0000
_cell.angle_gamma 90.0000
#
_symmetry.entry_id r3c7fsf
_symmetry.Int_Tables_number 19
_symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21'
#
loop_
_symmetry_equiv.id
_symmetry_equiv.pos_as_xyz
1 'X, Y, Z'
2 '-X+1/2, -Y, Z+1/2'
3 'X+1/2, -Y+1/2, -Z'
4 '-X, Y+1/2, -Z+1/2'
#
_reflns.entry_id r3c7fsf
_reflns.d_resolution_high 1.552
_reflns.d_resolution_low 27.703
_reflns.limit_h_max 44
_reflns.limit_h_min 0
_reflns.limit_k_max 47
_reflns.limit_k_min 0
_reflns.limit_l_max 68
_reflns.limit_l_min 0
_reflns.number_all 78553
_reflns.number_obs 76883


Я считаю, что в данных строках содержится вся необходимая информация о симметрии, ячейке, рефлексах, количестве структурных факторов и их амплитудах.


Назад