Последовательность белка XPT_Bacsu в формате FASTA
>sp|P42085|XPT_BACSU xanthine phosphoribosyltransferase
MEALKRKIEEEGVVLSDQVLKVDSFLNHQIDPLLMQRIGDEFAS
RFAKDGITKIVTIESSGIAPAVMTGLKLGVPVVFARKHKSLTLTDNLLTASVYSFTKQ
TESQIAVSGTHLSDQDHVLIIDDFLANGQAAHGLVSIVKQAGASIAGIGIVIEKSFQP
GRDELVKLGYRVESLARIQSLEEGKVSFVQEVHS
Файл в формате FASTA
Длина последовательности
- 194 а.о.Молекулярная масса белка XPT_Bacsu
- 21040,99 а.е.м.Подробнее смотрите книгу Credit2.xls, лист MW
Формула: (Сумма молекулярных масс всех аминокислот по таблице всех масс а.о.)-(Количество аминокислот-1)*(Молекулярная масса воды)
Аминокислотный состав белка XPT_Bacsu
 |
Самые частые аминокислотные остатки - A, L, S, V Самые редкие аминокислотные остатки - C, W Вычисления проведены см. книгу XPT_aa, лист aa_frequencies |
Средний электрический заряд молекулы
При рН=7.0 боковые группы аргинина и лизина имеют средний заряд, равный +1е, гистидина - +0.5е, а остатков аспарагиновой и глутаминовой кислот имеют средний заряд -1е, остальные аминокислотные остатки при рН=7.0 практически не заряжены. Заряд можно посчитать через сумму электрических зарядов всех аминокислот (Встречаемость * Электрический заряд одной аминокислоты)Средний заряд равен сумме зарядов всех аминокислот и он равен -1e
Сравнение со средним аминокислотным составом белков Bacillus Subtilis, а также с аминокислотным составом мембранных белков этой же бактерии
1 - гидрофобные ак
2 - гидрофильные ак
3 - все остальные
Вывод: Вывод: Белок XPT_BACSU скорее всего относится к немембранным, потому что диаграмма белка XPT_BACSU отличается от диаграммы мембранных белков.
См. подробнее книгу XPT_Bacsu, лист HPhob_comparison
