для пролина и глицина:
Для получения данных, я использовала команду "save phipsi <имя файла>" она сохраняет список углов φ и ψ в RasMol, а затем обработала полученные данные средствами Excel(мой Excel файл)
| Главная | Семестры | Проекты | Обо мне |
| Название двугранного угла | Угол определяется по координатам атомов (обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol, в скобках – название атома) | Данный угол описывает поворот вокруг связи | Результат измерения с помощью RasMol |
| φ | 1. VAL9:A.C (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А) 2. ILE10:A.N (азот 10-го остатка цепи А) 3. ILE10:A.CA (альфа-углерод α 10-го остатка цепи А) 4. ILE10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) |
N10 - Cα10 | -156.82º |
| ψ | 1. ILE10:A.N (азот 10-го остатка цепи А) 2. ILE10:A.CA (альфа-углерод 10-го остатка цепи А) 3. ILE10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) 4. SER11:A.N (азот 11-го остатка цепи А) |
Cα10 - C10 | 148.51º |
| ω | 1. ILE10:A.CA (α углерод 10-го остатка цепи А) 2. ILE10:A.C (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А) 3. SER11.N (азот 11-го остатка цепи А) 4. SER11:A.CA (альфа-углерод 11-го остатка цепи А) |
C10 - N11 | 174.35º |
Определение торсионного угла φ в RasMol:
Карта Рамачандрана для цепей:
для пролина и глицина:
Для получения данных, я использовала команду "save phipsi <имя файла>" она сохраняет список углов φ и ψ в RasMol, а затем обработала полученные данные средствами Excel(мой Excel файл)