Изучение матрицы BLOSUM62 Средний вес замен между аминокислотами.
Веса аминокислотных замен рассчитаны для Ala, Asp и Arg.
Внутри группы NDEQ
2
Внутри группы KRH
2,22
Между группами NDEQ и KRH
0
Таким образом, внутри второй группы средний вес замен аминокислот больше, чем внутри первой, а оба значения больше среднего
веса замен аминокислот между двумя группами.
Вычисление весов замен аминокислот на основе блока Средний вес замен аминокислот:
A-A
7,45
A-R
3,08
A-N
-0,26
Аналогичные данные из матрицы blosum62:
A-A
4
A-R
-2
A-N
6
Таким образом, результаты расчетов относительно пар резко различаются с данными из матрицы blosum (причем у двух последних
значений не совпадают знаки).