Структурная классификация

В этом практикуме надо было сравнить предлагаемые разными базами данных домены какого-нибудь белка. Я выбрала комплекс пуринового репрессора с ДНК из отсюда, PDB 1QP7. Результат представлен в таблице 1.

**Таблица 1. Сводная таблица классификаций доменов для пуринового репрессора (PDB ID: 1QP7).**
База данных структурных классификаций	Количество доменов	Название доменов	Расположение, ао
SCOP	2	d1qp7a1 d1qp7a2	3-38 59-340
ECOD	3	e1qp7A4 e1qp7A5 e1qp7A3	3-55 58-159 160-340
CATH	3	1qp7A01 1qp7A02 1qp7A03	3-59 60-161_292-323 162-291_324-340
Pfam	2	LacI Peripla_BP_3	2-47 169-330

Видно, что один домен определяется всеми однозначно, а все остальное считается либо одним доменом (Pfam и Scop), либо двумя, но по-разному (CATH и ECOD) (рис. 1).


Рис 1. Выделение доменов по CATH: желтый с бежевым и фиолетовый с красным (слева) ECOD (справа).