| Аланин | Alanine | A | ALA |  | часто | 1 | маленький | да | нет | | нет | 0 | да | да | нет | нет | нет | нет |
| Цистеин | Cysteine | C | CYS |  | редко | 2 | маленький | да | нет | боковая цепь может быть донором водородных связей; образует дисульфидные связи | нет | 0 | да | да | да | нет | да | нет |
| Аспартат (аспарагиновая кислота) | Aspartate (Aspartic acid) | D | ASP |  | часто | 4 | средний | нет | да | отрицательно заряженный; боковая цепь может быть акцептором водородных связей | нет | – | да | да | нет* | да | нет | нет |
| Глутамат (Глутаминовая кислота) | Glutamate (Glutamic acid) | E | GLU |  | часто | 5 | средний | нет | да | отрицательно заряженный; боковая цепь может быть акцептором водородных связей | нет | – | да | да | нет* | да | нет | нет |
| Фенилаланин | Phenylalanine | F | PHE |  | редко | 7 | большой | да | нет | ароматический | да | 0 | да | да | нет | нет | нет | нет |
| Глицин | Glycine | G | GLY |  | часто | 0 | маленький | нет | да | более слабые, чем для других а.к. ограничения на торсионные углы остова, часто встречается в поворотах полипептидной це | нет | 0 | да | да | нет | нет | нет | более слабые, чем для других а.к. ограничения на торсионные углы остова, часто встречается в поворотах полипептидной цепи |
| Гистидин | Histidine | H | HIS |  | средне | 6 | большой | нет | да | ароматический; положительно заряженный; боковая цепь может быть донором водородных связей | да | + | да | да | да | нет* | нет | нет |
| Изолейцин | Isoleucine | I | ILE |  | часто | 4 | средний | да | нет | | нет | 0 | да | да | нет | нет | нет | нет |
| Лизин | Lysine | K | LYS |  | средне | 5 | средний | да | да | положительно заряженный; боковая цепь может быть донором водородных связей | нет | + | да | да | да | нет* | нет | нет |
| Лейцин | Leucine | L | LEU |  | часто | 4 | средний | да | нет | | нет | 0 | да | да | нет | нет | нет | нет |
| Метионин | Methionine | M | MET |  | редко | 4 | средний | да | нет | | нет | 0 | да | да | нет | нет | нет | нет |
| Аспарагин | Asparagine | N | ASN |  | часто | 4 | средний | нет | да | боковая цепь может быть донором водородных связей; боковая цепь может быть акцептором водородных связей | нет | 0 | да | да | да | да | нет | нет |
| Пролин | Proline | P | PRO |  | редко | 3 | маленький | да | нет | не может быть донором водородных связей; жестко зафиксированные торсионные углы остова, характерные для α-спиралей; часто встречается в первом витке спира | нет | 0 | только на N-конце (и поэтому нехарактерен для центральной части спиралей и тяжей) | да | нет | нет | нет | жестко зафиксированные торсионные углы остова, характерные для α-спиралей; часто встречается в первом витке спирали |
| Глутамин | Glutamine | Q | GLN |  | часто | 5 | средний | нет | да | боковая цепь может быть донором водородных связей; боковая цепь может быть акцептором водородных связей | нет | 0 | да | да | да | да | нет | нет |
| Аргинин | Arginine | R | ARG |  | средне | 7 | большой | да | да | положительно заряженный; боковая цепь может быть донором водородных связей | нет | + | да | да | да | нет* | нет | нет |
| Серин | Serine | S | SER |  | часто | 2 | маленький | нет | да | боковая цепь может быть донором водородных связей; боковая цепь может быть акцептором водородных связей | нет | 0 | да | да | да | да | нет | нет |
| Треонин | Threonine | T | THR |  | часто | 3 | маленький | нет | да | боковая цепь может быть донором водородных связей; боковая цепь может быть акцептором водородных связей | нет | 0 | да | да | да | да | нет | нет |
| Валин | Valine | V | VAL |  | часто | 3 | маленький | да | нет | | нет | 0 | да | да | нет | нет | нет | нет |
| Триптофан | Tryptophan | W | TRP |  | очень редко | 10 | очень большой | да | нет | ароматический; боковая цепь может быть донором водородных связей | да | 0 | да | да | да | нет | нет | нет |
| Тирозин | Tyrosine | Y | TYR |  | редко | 8 | большой | да | нет | ароматический; боковая цепь может быть донором водородных связей; боковая цепь может быть акцептором водородных связей | да | 0 | да | да | да | да | нет | нет |
| | * да в протонированной (депротонированной) форме, которая реально не встречается |