Занятие 1. Работа в командной строке Linux

  1. Откройте терминал linux.

    • В Linux: Alt-F2, в открывшемся окне наберите gnome-terminal
    • В Windows: Запустите Putty и зайдите на сервер kodomo (см. занятие 3 прошлого блока).
    Все задания выполняйте в открывшемся окне терминала.
  2. Создайте директорию Practice1.

    Командой mkdir в своей домашней директории создайте директорию Term2, в ней - директорию Block1, в ней - директорию Practices, в ней - директорию Practice1. Для выполнения заданий перейдите в директорию Practice1 (т.е. сделайте ее текущей). Вопользуйтесь командами ls cd mkdir
  3. Получите информацию о своем белке.

    Команда infoseq sw:rs3_ecoli выдает на терминал информацию о записи RS3_ECOLI банка SwissProt. Запишите информацию о вашем белке в файл с именем 'ID_вашего_белка'.info.
  4. Запишите информацию о программе infoseq в файл.

    Команда infoseq -help выдает на терминал информацию о программе "infoseq". Помните, что на терминал выдаются как stdout, так и stderr.
  5. Найдите у себя файл имя которого содержит "bash_history".

    C помощью команды find найдите у себя файл, содержащий в своем имени строку "bash_history".
    Подсказки: Искать нужно не в рабочей директории (что find делает по умолчанию), а во всей вашей домашней директории. Используйте маски поиска "*" и не забывайте, что маски предназаначены для find, а не для bash, поэтому их надо защитить от bash.
    Что содержит в себе этот файл, и почему его не показывает ls?
    Изучите мануал команды ls и заставьте её показывать все файлы.
  6. Найдите у себя файл с пробелом в имени.

    Воспользуйтесь командой find. Если не нашли у себя (Вам повезло) поищите у всех однокурснков. Переименуйте так, чтобы не было пробела командой mv. (Если файл не Ваш -- скопируйте себе и переименуйте).

Учебная страница курса биоинформатики,
год поступления 2010

Cеместры Студенты Преподаватели