Поисковые системы

Записи в SwissProt

UniProt

В srs все очень наглядно, особенно, что касается статей, сразу даны ссылки,
на которых видно в каком они формате
написаны авторы, в поле с базами данных очень милый красные ссылочки, только вот
поле с ключевыми словами как то не особо заметно, милая диаграма и таблица с
особенностями последовательности. Есть последовательность в Fasta, которую можно сразу
скопировать, если надо, не то что в других. где всякие левые пробелы и числа.

MRS вцелом похожа на SRS, про особенности последовательности вообще мало и хиловатенько

Uniprot конеш не такой симпатичный, как SRS, зато в нем больше информации,
например есть поле генные ортологи, поле с ключевыми словами поприличнее, чем в SRS
особенности последовательности отражены неплохо, есть кнопочка детали, нажав на
которую можно увидеть более подробную информацию,хотя в SRS все равно лучше это поле

3.

   1.
          * bacillaceae(семейство)
          * bacillales(порядок)
          * bacillariaceae(семейство)
          * bacillariales(порядок)
          * bacillariophyceae(семейство)
          * bacillariophycidae(класс)
          * bacillariophyta(отдел)
          * bacillus(род)
   2. Записей, описывающих белки из рода Bacillus, в банке SwissProt 23013
   3. Записей, описывающих белки из отдела Firmicutes, в банке SwissProt 67277

Формулировка функции белка Строка запроса Количество найденных документов

Ribosome biogenesis GTPase ((((([swissprot-AllText:Ribosome biogenesis*] & [swissprot-AllText:GTP-ase*])) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*]) 0

Binds GTP and GDP ((([swissprot-AllText:Binds*] & [swissprot-AllText:GTP*]) & [swissprot-AllText:and*]) & [swissprot-AllText:GDP*]) | [swissprot-AllText:Binds GTP and GDP*]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*]) 539

Required for the association of ribosomal proteins (((((((([swissprot-AllText:Required*] & [swissprot-AllText:for*]) & [swissprot-AllText:the*]) & [swissprot-AllText:association*]) & [swissprot-AllText:of*]) & [swissprot-AllText:ribosomal*]) & [swissprot-AllText:proteins*]) | [swissprot-AllText:Required for the association of ribosoma l proteins*]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*]) 159

4.

Cохранила в Fasta 30 первых результатов последнего запроса

Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
Ribosome biogenesis GTPase	((((([swissprot-AllText:Ribosome biogenesis] & [swissprot-AllText:GTP-ase])) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*])	0
Binds GTP and GDP	((([swissprot-AllText:Binds] & [swissprot-AllText:GTP]) & [swissprot-AllText:and]) & [swissprot-AllText:GDP]) \| [swissprot-AllText:Binds GTP and GDP]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes])	539
Required for the association of ribosomal proteins	(((((((([swissprot-AllText:Required] & [swissprot-AllText:for]) & [swissprot-AllText:the]) & [swissprot-AllText:association]) & [swissprot-AllText:of]) & [swissprot-AllText:ribosomal]) & [swissprot-AllText:proteins]) \| [swissprot-AllText:Required for the association of ribosoma l proteins]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*])	159