Выравнивание последовательностей




Выравнивание вручную небольшой последовательности


Выравнивание в формате msf
Процент идентичности (Identities):
9/21*100%=42,9%

Процент сходства(Positives):
10/21*100%=47,6%

Эта последовательность схожа с участком 50 - 71 последовательности моего белка RBGA_BACSU AC 031743

Выравнивание белков RBGA_BACSU и DER_POLSJ .

RBGA_BACSUDER_POLSJ
AC 031743AC Q12AC2
Bacillus subtilisPolaromonas sp



первый участок 10-175 RBGA, 72-237 DERвторой участок 125-175 RBGA, 7-60 DER
Identities = 55/171 (33%)Identities = 22/54 (41%)
Positives = 86/171 (51%)Positives = 31/54 (58%)
Gaps = 10Gaps = 3


Карта локального сходства.

© Garanina Irina