PSI-Blast

ID белка	AC белка	Число итераций	Для первой итерации			Для последней итерации
ID белка	AC белка	Число итераций	Число находок выше порога (0,005)	Худшее E-value выше порога	Лучшее E-value ниже порога	Число находок выше порога (0,005)	Худшее E-value выше порога	Лучшее E-value ниже порога
MINC_ECOLI	P18196	5	161	0.004	0.006	886	2e-05	0.15
SSRP_ECOLI	P0A832	2	514	3e-10	5.6	514	5e-31	0.36
RP5M_RHIME	P17265	4	14	0.001	0.12	25	9e-15;	0.14
RBGA_BACSU	O31743	1, остальные из за большой выдачи не получается получить	670	0.004	0.006	670	0.004	0.006

С каждой последующей итерацией E-value лучших находок уменьшается, худших увеличивается.Отсутствие изменений в моем белке можно связать с увеличением количества находок, так что все равно будут находиться новые белки с E-value 0.005

Из-за огромной выдачи моего белка, я использовала первую последовательность из задания1.Для порога 0.005 список стабилизировался на 6ой итерации.При смене порога на 0.001 список стабилизировался уже на 3 итерации. Кроме того, произошло уменьшение количества гомологов. При пороге 0.003 не произшло стабилизации на 3 итерации. Возможно нельзя подобратьтакое же значение или оно должно отличаться от 0.001 не более чем на одну тысячную.