Паттерны и банк ProSite


паттерн с 319 по 327

Характеристика паттерна Паттерн В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены?
Фрагмент последовательности PNVGKSTLIN 59 ни один белок не найден
Сильный PN[VT]GKS[TS][LVI][IL]N 624 найдены все
Слабый N[VT]GKS[TS][LVI][ILM]N 884 найдены все


Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Protein kinase C phosphorylation site паттерн [TS][ES][KR] неспецифична 3
PS00007 TYR_PHOSPHO_SITE Tyrosine kinase phosphorylation site паттерн [KR][LF][DE][IE][VH]Y неспецифична 2
PS00008 MYRISTYL N-myristoylation site паттерн G[QILCG][GTRL][ITM][NSA][QVGY] неспецифична 5
PS00017 ATP_GTP_A ATP/GTP-binding site motif A (P-loop паттерн GIPNVGKS неспецифична 1

© Garanina Irina