Третий семестр

Оглавление

• Структура тРНК
• Поиск гомологов белка CAN_ECOLI в банке EMBL и другая работа
• Поиск гомологов белка CAN_ECOLI и его гена с помощью пакета программ BLAST
• Поиск гомологов гена белка CAN_ECOLI с помощью программы Fasta34
• Поиск последовательности по банку данных программой Megablast
• Аннотация участка бактериального генома
• Cравнение аминокислотных последовательностей белков и нуклеотидных последовательностей соответствующих генов
• Описание модельного филогенетического дерева. Построение эволюционной модели.
• Сравнение разных способов оценки эволюционных расстояний между гомологичными нуклеотидными последовательностями
• Реконструкция филогенетического дерева с помощью 4-х разных методов (методы UGPMA, Neighbor-Joining, Maximum Likelihood, Parsimony).
• Бутстреп-анализ и визуализация деревьев в пакете PHYLIP