Эволюция доменов. Pfam

1. PF02110.xlsx (сводная таблица о доменной организации всех последовательностей)
2. выравнивание отобранных мной последовательностей в формате msf
3. Дерево, построенное по данному выравниванию:
   
4. Скобочная формула дерева:
((1B_A3NJS6_:0.58764,1B_A4AHQ3_:0.34545):0.03363,((1B_A3K893_:0.27207, 1B_A3U007_:0.34650):0.06273,((1B_A1SX95_:0.55216,(((1B_A2RKJ5_:0.89959, 1B_A5K8Q9_:0.87762):0.02446,(((((2E_A1CSW0_:0.05472,(2E_A1DGJ4_:0.00905, 2E_B0XRU4_:0.01464):0.02313):0.27524,((2E_A6SCD0_:0.04687, 2E_A7F7I3_:0.05965):0.14891,(2E_A7UVT5_:0.22061,2E_B2AVR9_:0.21100):0.03881):0.05624):0.05727, 2E_A4R8K4_:0.24952):0.23406,(2E_A5DXB6_:0.51721,(2E_A6ZW41_:0.26712, 2E_A7TE74_:0.23738):0.30860):0.12677):0.02545,((2E_A8N7H4_:0.21117, 2E_B0D1A0_:0.23226):0.25234,2E_A8PSG5_:0.44771):0.04208):0.10313):0.01964, (1B_A6BJR1_:0.15349,2E_A8SP52_:0.16239):0.50977):0.07586):0.04450, 1E_A8HY76_:0.42079):0.01997):0.06212,1B_A1A2J2_:0.57811);
5. Выводы:
Если обратить внимание на представленное выше дерево, можно установить то, что последовательности 1E_A6HY76 и 2E_A8SP52, выровнены неправильно.