Отчет о работе с RasMol, Карта Рамачандрана для белка 1F80 (pdb)

Задание 1.
У десятого аминокислотного остатка моего белка с помощью RasMol были измерены углы фи, пси и омега.
Результаты приведены в таблице ниже.
Название двугранного угла Угол определяется по координатам атомов Данный угол описывает поворот вокруг связи Результат измерения с помощью RasMol
φ ALA10:A.C
(карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
ALA10:A.CA
(альфа-углерод 10-го остатка цепи А)
ALA10:A.N
(азот 10-го остатка цепи А)
ARG9:A.C
(карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
Calphai-Ni -128.14
ψ ALA10:A.N
(азот 10-го остатка цепи А)
ALA10:A.CA
(альфа-углерод 10-го остатка цепи А)
ALA10:A.C
(карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
VAL11:A.N
(азот 11-го остатка цепи А)
Calphai-C'i 125.76
ω ALA10:A.O
(альфа-углерод 10-го остатка цепи А)
ALA10:A.C
(карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
VAL11:A.N
(азот 11-го остатка цепи А)
VAL11:A.CA
(альфа-углерод 11-го остатка цепи А)
C'i-Ni+1 179.15


Задание 2.
В этом задании я получил изображение, иллюстрирующее определение угла Phi.
Оба рисунка приведены ниже.
! !!!
Задание 3.
после этого была построена карта Рамачандрана для всего белка и отдельных множеств аминокислотных остатков (а. о.).
Отчет включает в себя диаграммы, отражающие наиболее характерные торсионные углы.
Первая диаграмма отражает значения углов во всем белке, в-листах и а-спиралях.
!

Вторая диаграмма содержит данные о торсионных углах во всем белке и только в глицине.
!

файлы отчета прилагаются.
книга Excel *.xlsx прилагается
книга Excel *.xls (на всякий случай)



© Aleshin Vasily