Четвертый семестр

Эволюция доменов

    Домен с идентификатором PF00762, Ferrochelatase (феррохелатаза).

    Из 7 архитектур выбраны 2:

    A+B (Ferrochelatase, Chloroa_b-bind), A (Ferrochelatase)

    Встречаемость домена Ferrochelatase
    ЦарствоКоличество последовательностейКоличество видов
    Прокариоты16111447
    Эукариоты221160
    Археи99
    Всего18491610

    Ссылка на Pfam

  1. Файл Excel со всеми структурами, содержащими Ferrochelatase.
  2. Файл с выравниванием.
  3. Филогенетическое дерево

    Фиолетовыми линиями указаны организмы с доменной архитектурой A, голубыми - A+B. Желтыми ромбиками указаны прокариоты, красными - эукариоты.

    Дерево оказалось построено не правильно, некоторые эукариоты и прокариоты находятся на одной ветви. Возможно в ходе эволюции произошла потеря одного из доменов, но на самом деле доверять этому дереву не стоит.

Четвертый семестр


© Migur Anzhela 2010