Базы последовательностей белков

Текстовое описание:

В работе изучается способ отыскания информации о белке YP_004339259.1, синтезируемый бактерией Hippea maritima, штамм DSM10411, в различных базах данных.

1. С помощью системы uniprot, расположенной по адресу uniprot.org, найдены следующие идентификаторы записей о белке в разичных базах:

2. С помощью сервиса "history – compare" проведено сравнение состояния записи о белке на моменты 2015-03-11 и 2011-05-31. Сервис выделил несколько изменений, среди которых:

• Замена идентификатора белка:
  
• Приведены альтернативные именования белка в различных номенклатурах:
  
• Добавлена информация о других базах данных, содержащих записи с этим белком:
  

3. Для сравнения были выбраны S7THW2 и Y1I1W6, особых различий между ними замечено не было, за исключением молекулярных масс: 44,824 против 45,027 ( см. Excel-таблицу). Остальные поля из категорий “function” и “sequences” не содержали либо различий, либо записей.

Добавлена сравнительная таблица для гомолога с известной структурой MURA_ENTCC: гомолог содержит 28 бета-тяжей, 19 альфа-спиралей, 4 бета-поворота. uniprot-MURA_ENTCC-F2LXL4.xls.

4. В записях по своему белку требуемые примеры найдены не были. Поэтому пользуюсь примером из раздела «помощь» для сульфидных связей белка-ингибитора альфа-амилазы WDAI-3, кодируемого геном IHA-B1-2 организма Triticum aestivum (пшеница мягкая). Связи в записи представлены следующим образом:

Протокол выполнения задания в формате docx