Работа в программе RasMol Контакты в молекуле белка
Гидрофобные контакты
Общий вид соседних с остатками фенилаланинов атомов
Здесь я выделил предположительно гидрофобный кластер, состоящий из следующих аминокислот:
PHE122:A, PHE150:A, TRP179:A, ILE118:A, ILE132:A. LEU174:A, PRO145:A, VAL130:A
Водородные связи
Общий вид атомов кислорода, входящих в боковые радикалы аминокислот, и окружающие их атомы
Выделенная пара образующих связь кислород-кислород аминокислот:
SER83:A, GLU69:A
Общий вид атомов азота, входящих в боковые радикалы аминокислот, и окружающие их атомы
Выделенная пара образующих связь азот-азот аминокислот:
HIS166:A. ASN128:A
Дисульфидные мостики в инсулине
Общий вид дисульфидных мостиков в молекуле инсулина
Выделенная пара образующих дисульфидную свзяь аминокислот:
CYS6:A, CYS11:A
Контакты с лигандом
Имя атома контакта
Имя контактирующего атома белка
Расстояние в A
Предположительная природа контакта
Cl 184 F
Gly108F.N
3.90
Водородная связь
Cl 184 F
Thr111F.N
3.71
Водородная связь
Cl 184 F
Arg147F.NH2
3.97
Водородная связь
Из-за больших размеров иона хлора (ван-дер-ваальсов радиус 1.75 A) расстояние между атомами будет больше, чем в обычной водородной связи
