| Команда | Значение |
| velveth work_directory 31 -fastq -short chr2t.fastq | Выделение k-меров. |
| velvetg work_directory | Сборка контигов. |
| makeblastdb -in /nfs/srv/databases/ngs/Human/chr2.fasta -dbtype nucl -out chr2 | Создание базы данных из файла хромосомы. |
| blastn -query contigs.fa -db chr12 -outfmt 6 -out blast.out | Поиск по базе. |