Цель задания - знакомство с поисковой системой SRS. Задание состоит в заполнении таблиц, приведённых в файле SRS_tables.doc.
Задание 1: Определить группы, в которых находятся банки данных Swiss-Prot, EMBL и PDB. Результаты, полученные с помощью страницы Library Page приведены в таблице 1.
Задание 2: Определить английский эквивалент таксона "гамма-протеобактерии" и количество документов в банке Swiss-Prot, описывающих белки из этого таксона. Результаты занесены в таблицу 2.
Задание 3: Записать строку запроса, демонстрирующую параметры(Accession number и поиск с помощью БД Swiss-Prot), по которым был найден белок SYH_ECOLI, и число найденных документов в таблицу 3.
Задание 4: Составить выборку белков из таксона "гамма-протеобактерии", которые выполняют функцию, сходную с функцией моего белка (таблица 4). Подобно заданию 3 занести строку запроса и количество найденных документов в таблицу 3. Выбрать для поиска банк UniProt.
Задание 5: Найти (одним запросом к банку UniRef100) белки из организмов Yersinia pestis и Vibrio cholerae, которые выполняют функцию, сходную с функцией моего белка. Занести информацию о запросе в таблицу 3.
| На главную страницу семестра |