Цель задания - знакомство с программой GeneDoc.
Задание 1: Выровнять начальный кусок последовательности моего белка(примерно 60 а.о.) и тот же участок, но искусственно изменённый преподавателем(по всей видимости было произведено 3 замены). Совпадение наблюдается на большей протяжённости последовательности. Моё выравнивание соответствует максимально возможному значению веса(оно равно 26). Результаты выравнивания и вычисление веса представлены здесь: first_aln.txt.
Задание 2: С помощью редактора GeneDoc я построил выравнивание аминокислотных последовательностей белка SYH_ECOLI и одного из его гомологов (AC=Q8ZCT6) из генома Yersinia pestis (в предыдущем задании аминокислотная последовательность его была установлена и сохранена в формате FASTA). Результаты выравнивания находятся в файле second_aln.msf в формате MSF. Выравнивание, выполненное редактором, оказалось удачным. В меню "Configure" можно поменять различные конфигурации, с помощью которых я добился параметров:
| На главную страницу семестра |