EMBOSS

Организмы

Название организма Sulfolobus solfataricus E.coli (K12)
Идентификаторы протеомов UP000001974 UP000000625
Количество последовательностей 2938 4313
Количество аминокислот в последовательностях 827882 1351622

Сравнительный анализ протеомов Sulfolobus solfataricus (strain ATCC 35092) и Escherichia coli (strain K12)

Amino acid % в Sulfolobus solfataricus % в E.coli (K12) Разность процентов
L 10,356% 10,676% 0,320%
I 9,500% 6,010% 3,490%
K 7,692% 4,406% 3,287%
V 7,448% 7,073% 0,375%
E 6,807% 5,766% 1,041%
S 6,716% 5,797% 0,919%
G 6,440% 7,370% 0,930%
A 5,621% 9,512% 3,890%
N 4,977% 3,937% 1,040%
Y 4,820% 2,845% 1,976%
T 4,734% 5,394% 0,660%
D 4,694% 5,149% 0,455%
R 4,684% 5,519% 0,835%
F 4,434% 3,893% 0,541%
P 3,814% 4,428% 0,615%
M 2,201% 2,823% 0,622%
Q 2,102% 4,443% 2,341%
H 1,294% 2,268% 0,974%
W 1,049% 1,532% 0,483%
C 0,618% 1,161% 0,543%

Комментарий к таблице: три самые частые аминокислоты у Sulfolobus solfataricus- Лейцин L(10,356%), Изолейцин I(9,500%) и Лизин K(7,692%). У E.coli- Лейцин L(10,676%), Аланин A(9,512%), Глицин G (9,512%). Самые редкие у Sulfolobus solfataricus Гистидин H(1,294%),Триптофан W(1,049%), Цистеин C(0,618%).У E.coli-Гистидин H(2,268%), Триптофан W(1,532%), Цистеин C(1,161%). Самая большая разница в пользу E.coli у аланина A(3,890%), а в пользу Sulfolobus solfataricus у Изолейцина I(3,490%).

Здесь вы можете загрузить таблицу Exel


© Бердникович Екатерина, 2017