Краткое описание генома вируса Croton yellow vein mosaic alphasatellite
Данный вирус относится к группе
Вирусов-сателлитов. Как правило длина их ДНК варьирует от 1300 до 1400 п.н..
Они не могут строить себе капсид самостоятельно. Поэтому после инфицирования клетки они ждут
заражения этой клетки другим вирусом (геминивирусом в нашем случае), за счет которого начинает
размножаться. Таким образом сателлиты являются гиперпаразитами (то есть паразитами паразитов).
Обнаружен в хлопковых районах северо-западной Индии. Вызывает прожилковую желтую мозаику у кротона.
Краткую информацию о вирусе вы можете найти в Таблице 1. Изображение здорового и пораженного листа - на рисунке 2.
Аминокислотная последовательность белка представлена ниже:
>YP_003433564.1 replication protein
MSHSRNWCFTIFNYVLPLFTTLPEWANYLVFQEEECPTTKKRHIQGYVNLKRNQRFAFLK
KKLPDGSHIEPCRGSASSNRDYCTKDASRTGGPWEFGVFCETGSNKRKTMERFQEDPEEL
RLADPKLYRRCLATKVNTEFSGLVLPVPDRPWQLVAQKALDQGPDDRTIIWVYGSEGNEG
KTTWAKIKIQEGWFYSRGGKGENIKYQYAEHLGHCVFDIPRQVEDNLQYTVLEEIKDRLI
RSSKYEPIDFNCSDKVHLVVLSNFLPCLDVEYNNRGELVKKPLLSRDRVFIINIDESVCG
HPDDLKNFDVYLE
|
Таблица 1. Краткое описание генома вируса |
Параметр |
Значение |
Латинское название вируса |
Croton yellow vein mosaic alphasatellite |
Русское название вируса |
Альфасателлит-вирус желктой прожилковой мозаики кротона |
Количество фрагментов в полном геноме |
1 |
Общая длина генома (п.н.) |
1347 |
Количество кодируемых в геноме белков |
1 |
Источники:
- Страница первого семестра
- A. Chatterjee, A. Roy and S. K. Ghosh, First record of a begomovirus associated with yellow vein mosaic
disease of Urena lobata in India, Australasian Plant Disease Notes, 2007, 2, 27–28
- NC_013801.gbk
- Практикум 5. Задание
- Вирусы-сателлиты