Программой retree.exe пакета PHYLIP укоренил дерево в средней точке. Результат визуализировал с помощью MEGA (рисунок ниже).

Укоренение было произведено в ветке {LACDA, LACAC} против {STAAR, STAES, LISMO, LACLM, STRP1, STRPN} , она нетривиальная. Укоренение произведено неверно, так как тип Firmicutes делится на классы Bacillales и Lactobacillales ветвью {STAAR, STAES, LISMO} против {LACDA, LACAC, LACLM, STRP1, STRPN}.