Используя выравнивание 10 последовательностей РНК-зависимых РНК полимераз (RdRP) вирусов из pfam семейства pf00680, созданное в классе, был сделан профиль.
Далее с помощью данного профиля я осуществила поиск по белкам вирусов (файл sw-viruses.fasta), выбирая все находки с весом больше 1.
На основе полученного результата в Exel была построена ROC-кривая.
Для расчета использовались формулы, приведенные в примере для расчета ROC-кривой.
Для отличения правильных находок от неправильных был выбран порог веса 2.
