Первая версия программы. Для работы нужны ClustalW (2.1 и выше), HMMER (3.0 и выше). Clustal Omega (1.2.2 и выше) и BAGG необязательны, но желателен – без них построение зародышевого выравнивания и поиск интересующих участков в зародышевом выравнивании надо производить вручную.