Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)
Поиск метаболических путей, в которых участвует фермент
Изучаемый фермент - аденозин киназа (AC: P55263). В документе его идентификатор гена KEGG - hsa:132.
Был произведен поиск по KEGG-идентификатору гена на главной странице KEGG.
Результаты можно увидеть в таблице 1
Таблица 1. Метаболические пути, ассоциированные с аденозин киназой.
Идентификатор KEGG |
Название на английском |
Название на русском |
hsa00230 |
Purine metabolism |
Метаболизм пурина |
hsa01100 |
Metabolic pathways |
Метаболические пути |
Рисунок 1. Карта пути hsa00230. Красным выделена аденозин киназа.
Для увеличения картинки можно кликнуть по изображению
Поиск структурных формул соединений в KEGG
Для изучения были выбраны L-лизин и ацетил-кофермент А. В таблице 2 выложены результаты поиска в KEGG этих соединений.
Таблица 2.
Название на русском |
Название на английском |
Идентификатор |
Структурная формула |
L-лизин |
L-lysine |
C00047 |
|
Ацетил-кофермент А (ацетил-КоА) |
Acetyl coenzyme A (acetyl-CoA) |
C00024 |
|
Метаболический путь от одного заданного вещества к другому
Выбранная цепочка ферментативных реакций
Карта: деградация лизина.
Путь: L-лизин -> ацетил-КоА.
Промежуточные соединения: C01142, C01186, C03656, C00164, C00332.
Рисунок 2. Цепочка ферментативных реакций. Красным выделено начальное вещество, зеленым - конечное, а желтым - промежуточные.
Для увеличения картинки можно кликнуть по изображению.
|