Описание доменной структуры IHFA_ECOLI

По идентификаторам UniProt было найдено описание доменной структуры IHFA_ECOLI(P06984) в базе данных Pfam.

Это изображение доменной структуры а/к последовательности IHFA_ECOLI

1. PF00216 — идентификатор Pfam домена
2. Bac_DNA_binding — сокращенное название
3. Полное название — бактериальный ДНК-связывающий белок
4. Положение домена в последовательности — 3-92 а.о.

Изображение положения домена в 3D-структуре:

Идентификатор PDB — 1ihf.

Описание семейства доменов, к которому относится N-концевой домен IHFA_ECOLI

1. Описание доменов данного семейства:

   Бактерии синтезируют набор небольших,обычно в 90 а.о. белков, которые связывают ДНК (гистон-подобные белки).
   Это в том числе белок HU из Escherichia coli (кишечная палочка) — димер близкородственных α и β цепей, в других бактериях тоже встречаются димеры этих цепей.
   Белки типа HU были найдены во множестве эубактерий, цианобактерий и архебактерий и были также закодированы в геноме хлоропластов некоторых водорослей.
   Клеточный фактор интеграции (IHF) — это димер из очень схожих цепей, которые функционируют в генетической рекомбинации так же хорошо, как и в контроле за трансляцией и транскрипцией.

   Точная функция этих белков пока не ясна, но они способны изгибать ДНК и стабилизировать ее от денатурации в неблагоприятных условиях.
   Изветна структура одного из таких белков. Это димер, а 2 его "β-концы" функционируют как неспецифические связывающие "площадки" для бактериальной ДНК.

2. Описание таксонов, в которых встречаются белки с такими доменами:

   Таксон		Количество белков с доменом PF00216
   Эукариоты	Растения	1
   	Грибы	0
   	Животные	0
   Бактерии		18
   Археи		3

3. Вопросы относительно доменной архитектуры:
   • Известно 504 белка с доменом PF00216
   • Чаще всего, домен PF00216 единственный
   • Случаев дупликации домена PF00216 нет

В начало