Второй семестр
Программы, с которыми мы работали: FAR manager
Internet Explorer,
Microsoft Word,
Microsoft Excel,
GeneDoc,
Пакет программ EMBOSS:
needle (программа попарного глобального выравнивания),
water (программа попарного локального выравнивания),
matcher (программа попарного локального выравнивания),
emma (программа множественного выравнивания),
В нескольких словах опишу то впечатление, которое осталось у меня о далёком втором семестре после долгого и весёлого лета.
За второй семестр, по моим впечатлениям, мы получили чуть ли не в два раза больше информации и ознакомились с программами, которые станут неотъемлемой частью нашей дальнейшей профессиональной деятельности.
По моим представлениям, любой биоинформатик безусловно должен уметь пользоваться
программами для построения выравниваний и филогенетических деревьев, а также
понимать алгоритмы подобных программ для предвиденья возможных ошибок
в результатах. Кроме того, очень важной оказалась вторая часть, связанная
с базами данных доменов. К сожалению, не прочувствовав сразу всей серьёзности
второго семестра, я не уложился в срок.
Спешу исправиться :)
1.Создание выборки белков с одинаковыми функциями
2.Blastp
3. Алгоритмы попарного выравнивания
5.Деревья