Учебный сайт Николаевой Дарьи

Диагностические позиции

Диагностическими называются позиции последовательности, позволяющие судить о ее принадлежности к некоторому таксону.
В выравнивании последовательностей белка пептидил-тРНК гидролазы 8 выбранных видов протеобактерий (Рис. 1) было найдено 4 типа диагностических позиций (отмечены соответствующими буквами в строке "Taxon"):

A - принадлежность к классу Alphaproteobacteria (таких позиций больше всего)
Y - род Yersinia
E - порядок Enterobacteriales
A/G - позиция демонстрирует принадлежность части последовательностей к классу Alphaproteobacteria, а части - к Gammaproteobacteria

Рис. 1. Выравнивание последовательностей белка пептидил-тРНК гидролазы представителей протеобактерий.

Рис. 2. Участок выравнивания; диагностическая позиция класса Alphaproteobacteria.

Рис. 3. Участок выравнивания; диагностическая позиция рода Yersinia.

Рис. 4. Участок выравнивания; диагностическая позиция порядка Enterobacteriales.

Рис. 5. Участок выравнивания; диагностическая позиция классов Gammaproteobacteria и Alphaproteobacteria.