На главную страницу второго семестра

Матрицы замен.

1. На первой странице нижеуказанного файла находится таблица blosum62. Основываясь на ее данных был вычеслен средний вес замен внутри группы аминокислот AGST, NDEQ и между группами. Значения составили соответсвенно 0; 0,83; -0,8125.
2. На странице block_pairs находится один из блоков, относящихся к белку AMPA_ECOLI. На основе данной страницы, а так же частоты аминокислотных остатков(взятых с сайта задания), рассчитаны веса аминкислотных замен для трех пар аминокислот - A-A (25,422), A-C (14,122), A-D (18,383). По сравнению с таблицей blosum62, значение для А-А необычайно высоко (blosum62 - 4), А-С - также высоко(blosum62 - 0), а для A-D (blosum62 - -2) - опять же завышено.