Практикум 3

Анализ записи PDB для белка 7FRT.

Структура в целом

• В записи представлен белок. Если быть точным, человеческая гидролаза.
• В структуре присутствует одна цепь.
• Соответственно, в биологическую единицу также входит одна цепь.

Отдельные цепи

• Белок 7FRT принадлежит человеку(Homo sapiens).
• В базе UniProt:
  • ID: PTN1_HUMAN
  • Название: Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1
  • Функция: регулятор ответа ЭПР на "развёрнутые" белки. Также может играть роль в некоторых сигнальных путях клетки.
• Относительно референсной последовательности из UniProt есть мутации в позициях 32(S->C) и 98(V->C).
• Модифицированных аминокислотных остатков в молекуле нет(поиск "MODRES" по 7FRT.pdb не дал результатов).

Малые молекулы

• В записи присутствует одна малая молекула - TRS (2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL), или трис-буфер.
• Все HETATM в файле .pdb.