Подготовка работы

Мой номер - 51. Я получил файл с названием "51_F.ab1". Больше на диске файлов с таким названием не было. Работал в UGENE.

Характеристика хроматограммы

• Длина: 691 bp
• Начальный трудно читаемый фрагмент: ~13 bp
  
• Конечный трудно читаемый фрагмент: ~65 bp
  
• Шум:
  1. Нет
     
  2. Есть, но не мешает
     
  3. Мешает секвенированию
     
• Проблемные нуклеотиды:
  1. 1-22 - N
     • Пятна краски в начале сиквенса
     • Удалить всё и заменить на N
       
  2. 204 - A/T
     • Полиморфизм
     • Заменить N на T, так как T пропорционален остальным
       
  3. 221 - N
     • Разное расстояние между сигналами
     • Очень близкие пики T и G
     • Можно заменить N на GT
       
  4. 291 - N
     • Полиморфизм
     • Заменить N на A так как рядом есть буквально аналогичный пик, которому пропорционален пик A.
       
  5. 479-480 - NN
     • Полиморфизм
     • 479 заменить на G, так как там точный пик
     • 480 заменить на T, так как там тоже виден явный пик