Описание бактерии Streptococcus pneumoniae штамм R6

Streptococcus pneumoniae – это грам-положительная молочнокислая бактерия, возбудитель острой бактериальной пневмонии и отита у человека. Однако штамм R6 невирулентен, и поэтому повсеместно используется для изучения биологии патогенных штаммов S. pneumoniae [1].

Геном S. pneumoniae представлен кольцевой молекулой ДНК, описанной в записи NC_003098.1 базы данных Refseq. Длина генома – 2038615 пар нуклеотидов. В записи приведена последовательность одной из двух комплементарных цепей ДНК.

По данным из записи NC_003098.1 в геноме закодировано 1967 генов, из которых 1813 кодируют белки, 12 – рибосомальные РНК, 58 – транспортные РНК, 3 – иные РНК. По видимому, функции 81 гена остаются неизвестными.

Описание оперона АТФ-синтазы в геноме Streptococcus Pneumoniae штамм R6

АТФ-синтаза – белок, состоящий из многих субъединиц, главная функция которого состоит в синтезе АТФ – молекул, аккумулирующих энергию. Альфа-субъединица АТФ-синтазы (atpA) закодирована на комплементарной цепи.

Рис. 1. Оперон, содержащий субъединицы АТФ-синтазы Streptococcus pneumoniae штамм R6 (ограничен фиолетовыми линиями). Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

Гены, предположительно входящие в оперон, также описаны в таблице 1, из которой следует, что все белки, кодируемые входящими в предположительный оперон генами, являются компонентами АТФ-синтазы.

Таблица 1. Гены, предположительно входящие в один оперон с геном, кодирующим atpA

[1] Joann Hoskins et al., Genome of the Bacterium Streptococcus pneumoniae Strain R6, Journal of Bacteriology, October 2001, pp 5709–5717. (Читать)