Изображение нуклеотидов и фрагментов нуклеиновых кислот в программе СhemSketch


сайт ФББ

сайт МГУ

ChemSketch - программа, предназначеная для изображения структурных формул химических соединений. В этом практикуме моей целью было обучиться применять некоторые возможности этой программы.

Задание 1

Были построены следующие химические структуры:

  • 2'-Дезоксигуанозиндифосфат

  • 2'-Дезокситимидинмонофосфат

  • Уридин

  • Псевдоуридин

На рисунках красным цветом выделена N-гликозидная связь и атомы, между которыми она образуется. Как можно заметить, в псевдоуридине такой связи нет: остатки сахара и основания в нем связаны С-гликозидной связью.

2'-Дезоксигуанозиндифосфат

2'-Дезокситимидинмонофосфат

Рис. 1. 2'-дезоксигуанозиндифосфат

Рис. 2. 2'-дезокситимидинмонофосфат

Уридин

Псевдоуридин

Рис. 3. Уридин

Рис. 4. Псевдоуридин

Задание 2

Было смоделировано изображение фрагмента двухцепочечной цепи ДНК, содержащего 4 канонические пары нуклеотидов. Красным цветом выделен сахаро-фосфатный остов.

Цепь ДНК

Рис. 5. Фрагмент двухцепочечной цепи ДНК

Проект в формате sk2 с представленными на рисунках структурами вы можете скачать здесь.

© Дарья Горбачева

изменено 12.09.2015