Выбрал геном человека, самого важного и интересного организма из эукариот, у него должно быть 23 пары хромосом в сборке их 24 штуки (X и Y). Искал по запросу Homo sapiens (Human), выдача состояла из 1083 сборок. Из них выбрал GRCh38.p14, Сборка имеет хромосомный уровень, это значит, что она содержит последовательность ДНК одной или более хромосом, а также является референсной (была выбрана научным сообществом, в качестве стандарта высокого качества, с которым следует сравнивать остальные сборки). Seq и GenBank.
| GenBank ID | RefSeq ID | Размер генома (Mb) |
|---|---|---|
| GCA_000001405.29 | GCF_000001405.40 | 3,099 |
| Number of scaffolds | Scaffold N50 | Scaffold L50 |
|---|---|---|
| 470 | 67.8 Mb | 16 |
| Number of contigs | Contig N50 | Contig L50 |
|---|---|---|
| 996 | 57.9 Mb | 18 |
N50 — длина элемента, для которого 50% нуклеотидов сборки содержатся в элементах большей или равной длины.
L50 - наименьшее число элементов, в которых содержится 50% нуклеотидов сборки.