Мотивы в белке FABG_ECOLI описанные в БД Prosite

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00061 ADH_SHORT Коротко-цепочечные дегидрогеназо/редуктазо семейства паттерн [LIVSPADNK] - x(12) - Y - [PSTAGNCV] - [STAGNQCIVM] - [STAGC] - K - {PC} - [SAGFYR] - [LIVMSTAGD] - x - {K} - [LIVMFYW] - x(2) - {YR} - [LIVMFYWGAPTHQ] - [GSACQRHM] специфична 1
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования паттерн G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} неспецифична 8
PS00001 ASN_GLYCOSYLATION Сайт N-гликозилирования паттерн N - {P} - [ST] - {P} неспецифична 2
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования казеинкиназы II паттерн [ST] - x(2) - [DE] неспецифична 1

Коментарии

Ввел на главной странице PROSITE AC своего белка. Получил все мотвы к FABG_ECOLI. Чтобы посмотреть какие из них специфичны, на главной странице PROSITE поствил галочку напротив "Исключить паттерны с высокой возможностью встретится"
На главную страницу семестра


©Goryanin Ignat 2005