Что такое филогенетическое дерево.

НазваниеМнемоника
Rhodobacter sphaeroidesRHOS4
Burkholderia cenocepaciaBURCA
Ralstonia solanacearumRALSO
Neisseria meningitidisNEIMA
Pseudomonas aeruginosaPSEAE
Enterobacter sp. 638ENT38
Escherichia coliECOLI
Salmonella typhimuriumSALTY

Скобочная формула: (((((SALTY, ECOLI), ENT38), PSEAE), ((RALSO, BURCA), NEIMA)), RHOS4);

Дерево: см. рис. 1.


Рис. 1. Дерево

Разбиения:

  1. {SALTY, ECOLI} Vs {ENT38, PSEAE, RALSO, BURCA, NEIMA, RHOS4}
  2. {SALTY, ECOLI, ENT38} Vs {PSEAE, RALSO, BURCA, NEIMA, RHOS4}
  3. {SALTY, ECOLI, ENT38, PSEAE} Vs {RALSO, BURCA, NEIMA, RHOS4}
  4. {SALTY, ECOLI, ENT38, PSEAE, RHOS4} Vs {RALSO, BURCA, NEIMA}
  5. {SALTY, ECOLI, ENT38, PSEAE, NEIMA, RHOS4} Vs {RALSO, BURCA}

Нетривиальные ветви, означающие таксоны (см. табл. 1, данные о таксонах были получены с помощью таксономического сервиса NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/):

  1. сем. Enterobacteriaceae
  2. кл. Gammaproteobacteria
  3. тип Proteobacteria
  4. сем. Burkholderiaceae
  5. кл. Betaproteobacteria

ЦарствоТипКлассОтрядСемействоРодВидПодвид
Rhodobacter sphaeroides
(RHOS4)
BacteriaProteobacteriaAlphaproteobacteriaRhodobacteralesRhodobacteraceaeRhodobacter
Burkholderia cenocepacia
(BURCA)
BacteriaProteobacteriaBetaproteobacteriaBurkholderialesBurkholderiaceaeBurkholderiaBurkholderia cepacia complex
Ralstonia solanacearum
(RALSO)
BacteriaProteobacteriaBetaproteobacteriaBurkholderialesBurkholderiaceaeRalstonia
Neisseria meningitidis
(NEIMA)
BacteriaProteobacteriaBetaproteobacteriaNeisserialesNeisseriaceaeNeisseria
Pseudomonas aeruginosa
(PSEAE)
BacteriaProteobacteriaGammaproteobacteriaPseudomonadalesPseudomonadaceaePseudomonasPseudomonas aeruginosa group
Enterobacter sp. 638
(ENT38)
BacteriaProteobacteriaGammaproteobacteriaEnterobacteralesEnterobacteriaceaeEnterobacter
Escherichia coli
(ECOLI)
BacteriaProteobacteriaGammaproteobacteriaEnterobacteralesEnterobacteriaceaeEscherichia
Salmonella typhimurium
(SALTY)
BacteriaProteobacteriaGammaproteobacteriaEnterobacteralesEnterobacteriaceaeSalmonellaSalmonella entericaSalmonella enterica subsp. enterica

Таблица 1. Таксоны бактерий.

Дополнительное задание



НАЗАД ➜
© <Рюмина Екатерина>, 2018