|
Что такое филогенетическое дерево.
Название | Мнемоника |
Rhodobacter sphaeroides | RHOS4 |
Burkholderia cenocepacia | BURCA |
Ralstonia solanacearum | RALSO |
Neisseria meningitidis | NEIMA |
Pseudomonas aeruginosa | PSEAE |
Enterobacter sp. 638 | ENT38 |
Escherichia coli | ECOLI |
Salmonella typhimurium | SALTY |
|
Скобочная формула: (((((SALTY, ECOLI), ENT38), PSEAE), ((RALSO, BURCA), NEIMA)), RHOS4);
| Дерево: см. рис. 1.
Рис. 1. Дерево |
Разбиения:
- {SALTY, ECOLI} Vs {ENT38, PSEAE, RALSO, BURCA, NEIMA, RHOS4}
- {SALTY, ECOLI, ENT38} Vs {PSEAE, RALSO, BURCA, NEIMA, RHOS4}
- {SALTY, ECOLI, ENT38, PSEAE} Vs {RALSO, BURCA, NEIMA, RHOS4}
- {SALTY, ECOLI, ENT38, PSEAE, RHOS4} Vs {RALSO, BURCA, NEIMA}
- {SALTY, ECOLI, ENT38, PSEAE, NEIMA, RHOS4} Vs {RALSO, BURCA}
Нетривиальные ветви, означающие таксоны (см. табл. 1, данные о таксонах были получены с помощью таксономического сервиса NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/):
- сем. Enterobacteriaceae
- кл. Gammaproteobacteria
- тип Proteobacteria
- сем. Burkholderiaceae
- кл. Betaproteobacteria
|
| Царство | Тип | Класс | Отряд | Семейство | Род | Вид | Подвид |
Rhodobacter sphaeroides (RHOS4) | Bacteria | Proteobacteria | Alphaproteobacteria | Rhodobacterales | Rhodobacteraceae | Rhodobacter | | |
Burkholderia cenocepacia (BURCA) | Bacteria | Proteobacteria | Betaproteobacteria | Burkholderiales | Burkholderiaceae | Burkholderia | Burkholderia cepacia complex |
Ralstonia solanacearum (RALSO) | Bacteria | Proteobacteria | Betaproteobacteria | Burkholderiales | Burkholderiaceae | Ralstonia | | |
Neisseria meningitidis (NEIMA) | Bacteria | Proteobacteria | Betaproteobacteria | Neisseriales | Neisseriaceae | Neisseria | | |
Pseudomonas aeruginosa (PSEAE) | Bacteria | Proteobacteria | Gammaproteobacteria | Pseudomonadales | Pseudomonadaceae | Pseudomonas | Pseudomonas aeruginosa group |
Enterobacter sp. 638 (ENT38) | Bacteria | Proteobacteria | Gammaproteobacteria | Enterobacterales | Enterobacteriaceae | Enterobacter | | |
Escherichia coli (ECOLI) | Bacteria | Proteobacteria | Gammaproteobacteria | Enterobacterales | Enterobacteriaceae | Escherichia | | | |
Salmonella typhimurium (SALTY) | Bacteria | Proteobacteria | Gammaproteobacteria | Enterobacterales | Enterobacteriaceae | Salmonella | Salmonella enterica | Salmonella enterica subsp. enterica |
Таблица 1. Таксоны бактерий.
| |