Сравнение протеомов Halobacterium salinarum ATCC 700922 и Escherichia coli K12

                                                                                                                                                                          
 
Навигация по сайту
                              
 На Главную                                                                                                                                                         
 Здесь будут другие семестры
 1 семестр
 2 семестр
 Обо мне                                                                                                                                                                      
 Официальный сайт ФББ МГУ                                                                                                                                         

• Таблица 1. Общая информация о протеомах

  Характеристика	H.salinarum ATCC 700922	E.coli K12
  Proteome ID	UP000000554	UP000000625
  Кол-во последовательностей	2426	4313
  Всего аминокислот	680494	1351619

• Таблица 2. Сравнение процентного соотношения аминокислот в протеомах

  AA code	Процент в протеоме H.salinarum ATCC 700922	Процент в протеоме E.coli K12	Разница процентов
  A	0,126568346	0,095115561	0,031452785
  V	0,093984664	0,070730731	0,023253933
  D	0,089426211	0,051491582	0,037934629
  L	0,084607653	0,106757896	-0,022150243
  G	0,083333578	0,073704942	0,009628636
  E	0,069020447	0,05765974	0,011360707
  T	0,068262174	0,053940497	0,014321678
  R	0,065212919	0,05518641	0,010026509
  S	0,053719798	0,057966779	-0,004246981
  P	0,046902691	0,044283189	0,002619502
  I	0,037256758	0,060098297	-0,022841539
  F	0,031150899	0,03892665	-0,007775751
  Q	0,027278712	0,044434119	-0,017155407
  Y	0,025534391	0,028446626	-0,002912235
  H	0,022408721	0,022677249	-0,000268528
  N	0,022119225	0,039369083	-0,017249857
  K	0,017418229	0,044057534	-0,026639305
  M	0,017394716	0,02822541	-0,010830693
  W	0,010908252	0,015318666	-0,004410414
  C	0,007491616	0,011609041	-0,004117424

  

  Рисунок 1.Сравнение процентного соотношения аминокислот.

  Из рисунка и таблицы видно, что самые распространенные аминокислоты у H.salinarum - аланин, валин и аспаргиновая кислот, а у E.coli - лейцин, аланин и глицин. Общий в этих списках только аланин, так что можно сказать что совпадают они слабо. Самые редкие аминокислоты, наооборот, совпадают довольно сильно - цистеин, триптофан, метионин (H.salinarum) и цистеиин, триптофан, гистедин (E.coli). Это позволяет предположить, что самые редкие аминокислоты - "технические", они выполняют одну и ту же узкую функцию и, соответственно, встречаются в строго определённых местах.

  Наибольшая разница во встречаемости у аспаргиновый кислоты - 3.79%, и она в пользу исследуемой бактерии. А E.coli превосходит H.salinarum в лейцине и изолейцие - на 2.21% и 2.28% соответственно.

• Exel таблица

  ---

  © Сутырин Егор 2018