Практикум 6. Мотивы и профили

Требовалось на основе таблицы с числом букв в нескольких последовательностях Козак какого-нибудь организма составить позиционную весовую матрицу (PWM). Расчеты производились в Excel (они представлены в файле ниже на странице Sheet1): эмпирический подбор константы для создания псевдокаунтов, подсчет частот встречаемости оснований в каждой позиции и базовых частот для оснований, логарифмирование. Работа производилась с данными для Mus musculus, представленными на рис.1 статьи Grzegorski et al., PLoS ONE 9(9): e108475, 2014. Результат представлен в файле ниже.