Hа Главную
Второй Семестр
Kodomo Home
MEME & MAST
- Сводная таблица по мотивам
Motif # |
Lenght |
Alignment location |
E-value |
P-value |
All sequenses? |
LLR |
1 |
50 |
71-125 |
1.0e-295 |
1.38e-52 |
YES |
1356 |
2 |
34 |
139-208 |
3.9e-128 |
6.18e-28 |
YES |
795 |
3 |
34 |
189-243 |
5.3e-144 |
2.92e-95 |
YES |
823 |
На рисунке синим цвеом показаны мотивы, фиолетовым показано пересечение мотивов. Такое пересечение может быть объяснено ограничением на длину мотива.
IDI2_BACSU IDI2_BACCN отличаются в мотиве до 73 а.о. и после 234 а.о. относительно общего выравнивания.
Выравнивание в формате msf можно скачать тут
- Поиск мотивов с помощью MUST
Вывод MUST тут
- Все три мотива были найдены во всех заданных последовательностях
- Небольшой сдвиг в последовательности IDI2_ENTFA
© Кузнецов Виктор Петрович