Hа Главную
Второй Семестр
Kodomo Home

MEME & MAST

  1. Сводная таблица по мотивам

  2. Motif # Lenght Alignment location E-value P-value All sequenses? LLR
    1 50 71-125 1.0e-295 1.38e-52 YES 1356
    2 34 139-208 3.9e-128 6.18e-28 YES 795
    3 34 189-243 5.3e-144 2.92e-95 YES 823


    На рисунке синим цвеом показаны мотивы, фиолетовым показано пересечение мотивов. Такое пересечение может быть объяснено ограничением на длину мотива.
    IDI2_BACSU IDI2_BACCN отличаются в мотиве до 73 а.о. и после 234 а.о. относительно общего выравнивания.
    Выравнивание в формате msf можно скачать тут
  3. Поиск мотивов с помощью MUST
  4. Вывод MUST тут

© Кузнецов Виктор Петрович