Поиск участков локальной гомологии

Последовательности для которых строилось локальное выравнивание:


1).
MQTVLAKIVADKAIWVEARKQQQPLASFQNEVQPSTRHFYDALQGARTAFILECKKASPS
KGVIRDDFDPARIAAIYKHYASAISVLTDEKYFQGSFNFLPIVSQIAPQPILCKDFIIDP
YQIYLARYYQADACLLMLSVLDDDQYRQLAAVAHSLEMGVLTEVSNEEEQERAIALGAKV
VGINNRDLRDLSIDLNRTRELAPKLGHNVTVISESGINTYAQVRELSHFANGFLIGSALM
AHDDLHAAVRRVLLGENKVCGLTRGQDAKAAYDAGAIYGGLIFVATSPRCVNVEQAQEVM
AAAPLQYVGVFRNHDIADVVDKAKVLSLAAVQLHGNEEQLYIDTLREALPAHVAIWKALS
VGETLPAREFQHVDKYVLDNGQGGSGQRFDWSLLNGQSLGNVLLAGGLGADNCVEAAQTG
CAGLDFNSAVESQPGIKDARLLASVFQTLRAY


2).
AKIVADKAIWGIKDARLLAS

Программа matcher определила что участок 1 соответствует координатам 6-15, а участок 2 - координатам 435-444. 
    
       			    10     
			TRPC_E AKIVADKAIW
      	     	 		 ::::::::::
  			  seq3 AKIVADKAIW
                           10
			
          			    440    
			TRPC_E GIKDARLLAS
     			       ::::::::::
			  seq3 GIKDARLLAS
            			        20

Назад...