Acholeplasma laidlawii strain PG-8A

Acholeplasma laidlawii PG-8A - штамм бактерий вида Acholeplasma laidlawii, часто используемый в лабораторных исследованиях.

Вид Acholeplasma laidlawii принадлежит к грамотрицательным неспорообразующим бактериям класса микоплазмы, которые являются наиболее простыми самостоятельно воспроизводящимися живыми организмами с минимальным количеством генетической информации, необходимой для автономного самовоспроизведения.

Многие микоплазмы - паразитические бактерии, естественной средой обитания которых являются животные и высшие растения. Несмотря на маленький геном, они обладают пластичным метаболизмом, позволяющим им ускользать от иммунологической защиты макроорганизма. При изучении механизмов, обеспечивающих формирование резистентности к воздействию антибактериальных агентов, уделяется большое внимание детерминантам устойчивости, возникновению точечных мутаций, инактивирующих действие лекарств. Думаю, это и послужило главной причиной к секвенированию генома Acholeplasma laidlawii. Причем он является самым длинным среди других известных геномов микоплазм. Дополнительное же внимание ученых к данной бактерии вызвано особым строением ее плазматических мембран, а точнее роли их транспортной функции в формировании устойчивости к антибиотикам.

Acholeplasma laidlawii - первый российский бактериальный геном. Секвенирование: Институт Физико-Химической Медицины МЗ РФ, аннотация: ИППИ РАН. ~1,5 Mb; ~1400 генов. Установлены функции ~80% генов; проведена метаболическая реконструкция.

Наглядное представление работы российских ученых:

Другие особенности вида Acholeplasma laidlawii:

• отсутствие жесткой клеточной стенки
• отсутствие жгутика
• факультативная анаэробность
• мезофильность
• кольцевая ДНК
• возможность роста в среде без холестерола, в отличие от многих других микоплазм

Acholeplasma laidlawii strain PG-8A

Размер	1,5 Mbp (1,496,992 bp)
Геном	1433 гена
Кодирующие последовательности	1380 генов
Процент генов, кодирующих белки	90.62%
Средняя длина гена	983 bp

Содержание GC-нуклеотидов

Во всем геноме	31.92%
В кодирующих последовательностях генома	32.22%

Также геном Acholeplasma laidlawii сожержит последовательности полимеразы типа I, последовательности, ответственные за поведение бактерии в экстренных ситуациях, сигнальные системы трансдукции, РНК-регуляторные элементы, рибосвитчи и Т-боксы. Все это подтверждает способность вида регулировать экспрессию генов и возникновение мутаций в завистимости от условий среды.

Известно всего два вида микоплазм с универсальным генетически кодом, где UGA является стоп-кодоном, и один из них - Acholeplasma laidlawii. Другая особенность данного вида, как уже было указано выше - нетребовательность к холестерольным соединениям и способность самостоятельно синтезировать насыщенные жирные кислоты. Также для бактерии характерна посттрансляционная модификация белков путем их фосфорилирования и ацилирования. Идентифицировано 74 фосфорилируемых белка, из которых 16 - уникальны для Acholeplasma laidlawii, а 11 из них являются поверхностными или встроенными белками плазматической мембраны, что предполагает наличие активных сигнальных путей. Что касается ацилируемых белков, обнаружено 20, из которых 14 содержат пальмитиновые цепи, а 6 - стеариновые. При этом отсутствуют какие-либо остатки линолевой и олеиновой кислот. В основом же ацилированные белки представляют собой компоненты сахаров и систем транспорта неорганических ионов, а также отдельные поверхностные мембранные белки с неизвестными функциями.