Структура моего белка (LAAO, 1F8R) имеет недостаточно большое число структурных факторов, которые пригодны для оптимизации. Поэтому я решил поменять рабочую структуру.
Итак, 5HGI, представляющая белок IRE1_alfa. Это многодоменный белковый сенсор из эндоплазматического ретикулуума, являющийся трансрансмембранной киназой / эндорибонуклеазой, запускающей апоптоз в ответ на стресс.
Файл структурный факторов в формате cif: 5hgi-sf
Таблица Exsel с результатами: 5hgi-sf
Всего в файле присутствовало 19253 троек индексов Миллера (h,k,l), из них 18208 использовались для оптимизации модели (символ 'o' в графе о статусе). У 96.2% (18521) сила сигнала была больше 3.
Примеры пропущеных и неизмеренных троек (h, k, l), для которых есть измеренный структурный фактор:
h k l 0 0 3 0 0 5 0 0 7 0 0 9 0 0 11
© Борисов Евгений 2018