Geodermatophilus obscurus
Таксономия
Характеристика
Geodermatophilus obscurus(рис.1) – это аэробная, грамположительная бактерия, которая в своем геноме содержит большое количество гуанина и цитозина. Эти бактерии отличаются своей высокой устойчивостью к ионизирующему гамма-излучению, даже к дозе равной 30 кГр. Они населяют различные поверхности скал, камней и памятников, также обитают в сухих почвах. Они играют важную роль в разложении таких органических веществ, как целлюлоза и хитин, и таким образом принимают участие в круговороте органических веществ и в углеродном цикле.
Секвенирование генома
Этот организм был выбран для секвенирования на основе своего филогенетического положения, т.е. для того, чтобы восполнить коллекцию бактериальных геномов. Это является одной из задач проекта Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea.
Одна из статей о Geodermatophilus obscurus,найденная в БД PubMed.
Название статьи: Complete genome sequence of Geodermatophilus obscurus type strain (G-20).
Идентификатор статьи на PubMed: 21304698
Авторы: Ivanova N, Sikorski J, Jando M, Munk C, Lapidus A, Glavina Del Rio T, Copeland A, Tice H, Cheng JF, Lucas S, Chen F, Nolan M, Bruce D, Goodwin L, Pitluck S, Mavromatis K, Mikhailova N, Pati A, Chen A, Palaniappan K, Land M, Hauser L, Chang YJ, Jeffries CD, Meincke L, Brettin T, Detter JC, Rohde M, Goker M, Bristow J, Eisen JA, Markowitz V, Hugenholtz P, Kyrpides NC, Klenk HP.
Аннотация
Geodermatophilus obscurus Luedemann 1968 является типичным видом рода, который является типичным родом семейства Geodermatophilaceae. G.Obscurus интересна, т.к. была найдена в экстремальных условиях, таких как поверхности камней, пустыня, и как показывает фенотип, она способна растворять клеточные стенки дрожжей, способна продуцировать амилоиды и растворять марганец, также обладает устойчивостью к ультрафиолетовому излучению класса С. Geodermatophilus obscures является первой бактерией из семейства Geodermatophilaceae, геном которой секвенировали.
Запрос в PubMed, которым найдена эта статья: GEODERMATOPHILUS OBSCURUS 2000:2012[dp]
Рис.1. Микрофотография G. obscurus G-20T, полученная с помощью сканирующего электронного микроскопа.
Источники информации: