Белок URHG2 обладает рядом особенностей:

1. При синтезе белка на рибосоме первым (N-концевым) аминокислотным остатком обычно является остаток метионина. Однако в иследуемом мною белке первый мeтионин удален.

   ID URHG2_BACSU_1; parent: URHG2_BACSU
   FT INIT_MET 1 1 Removed.
   SQ Sequence 1 AA;
   M
   //

2. Связывание данного белка с субстратом осуществляется в следующих областях: с 40-го по 41-ый остаток, с 132-го по 136-ой, с 213-го по 217-ый, с 333-го по 334-ый.

   ID URHG2_BACSU_3; parent: URHG2_BACSU
   FT REGION 40 41 Substrate binding.
   SQ Sequence 2 AA;
   HY
   //

   ID URHG2_BACSU_4; parent: URHG2_BACSU
   FT REGION 132 136 Substrate binding.
   SQ Sequence 5 AA;
   HKDGY
   //

3. В активный центр данного белка входит аминокислотный остаток, выполняющий свойства кислот, то есть отдающий протон. Этим аминокислотный остатком является аспартат.

   ID URHG2_BACSU_7; parent: URHG2_BACSU
   FT ACT_SITE 143 143 Proton donor.
   SQ Sequence 1 AA;
   D
   //

4. По 143-му остатку возможен мутагенез, в результате которого аспартат заменяется на аспарагин, а это в свою очередь приводит к потери активности белка в качестве гидролазы.

   ID URHG2_BACSU_11; parent: URHG2_BACSU
   FT MUTAGEN 143 143 D->N: Loss of hydrolase activity.
   SQ Sequence 1 AA;
   D
   //

Список структур URHG2 банка PDB

• PDB:2D8L
• PDB:2GH4
• PDB:1NC5

Таблица встеречаемости в SwissProt белков из Firmicutes, имеющих функцию, сходную с функцией белка URHG2 из Bacillus subtilis

Полноразмерные последовательности найденных белков в fasta формате

Результатом первого запроса явились три белка, последовательности которых представлены в следующем файле: FastaSeq.

Cписок последовательностей, в котором указаны ID, AC последовательностей, организм, название белка и длина последовательности: table