Занятие 2. Банк EMBL
Мой белок — DHAS_ECOLI (AC:
P0A9Q9).
В записи SwissProt были найдены четыре записи EMBL в которых содержится мой белок. Из 4х записей одна (V00262) — аналогична записи о моего белке в EMBL, последовательности в обоих банках полностью идентичны (проверено с помошью needle). Остальные -- записи последовательностей, содержащих мой ген. Последние две — записи полных геномов разных штаммов кишечной палочки. Можно пронаблюдать процесс удешевления и усовершенствования технологий секвенирования: в 1983м году ученые расшифровывали лишь маленький кусочек и, только спустя 10 лет, практически весь геном, и еще через 10 — расшифровать весь геном у нескольких штаммов. #2 Сравнение описаний гена Escherichia coli в двух разных записях EMBLПоследовательности, кодирующие белок DHAS_ECOLI в двух записях банка EMBL:
Файлы gene1.fasta, gene2.fasta и gene1-gene2.needle находятся в директории задания.
Замена не синонимична. В первом случае закодирован аргинин, во втором — может стоять любой нуклеотид и, соответственно, может быть закодирован глицин, цистеин, серин или аргинин.
#3 Знакомство с записью гена из эукариотического генома
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||