1. Структура в целом:
Протеинконвертаза фурин - высокоспецифичная сериновая протеаза, участвующая в протеолитическом созревании многих белков секреторного пути. Она также активирует поверхностные белки многих вирусов, включая коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2). Ингибиторы фурина эффективно подавляют вирусную репликацию и, таким образом, являются перспективными противовирусными препаратами с широким потенциалом применения. Рентгеновская структура фурина в комплексе с ингибитором на основе гуанилгидразона 4 (mi359). Белок состоит из 1 полимерной цепи и 12 неполимерных молекул, не включая воду. Асимметрическая единица совпадает с биологической.
Рис.1 Общий вид хода остова фрагмента белковой цепи.
2. Описание цепи и фрагмента:
| Характеристика цепи | Furin |
|---|---|
| Организм | Homo sapiens |
| uniprot_id | P09958 |
| Название | FURIN_HUMAN |
| Наличие мутаций | - |
| Наличие модифицированных аминокислотных остатков | - |
Табл.1 Описание цепи
Функции:
Опосредуя процессинг вспомогательной субъединицы ATP6AP1/Ac45 V-АТФазы, регулирует закисление плотноядерных секреторных гранул в островках клеток Лангерганса (По сходству). Высвобождает зрелые белки из их пропротеинов путем расщепления связей -Arg-Xaa-Yaa-Arg-|-, где Xaa может быть любой аминокислотой, а Yaa - Arg или Lys. Высвобождает альбумин, компонент комплемента C3 и фактор фон Виллебранда из их соответствующих предшественников.
Рис.2 Вторичные структуры в составе фрагмента.
3. Малые молекулы:
| ID (краткое наименование) | Name (полное наименование) | Формула | Фрагменты pdb-файла |
|---|---|---|---|
| UYW | [azanyl-[(2E)-2-[[2-[(4-chlorophenyl)methoxy]phenyl]methylidene]hydrazinyl]methylidene]azanium | C15H16ClN4O | UYW |
| NAG | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose | C8H15NO6 | NAG |
| DMS | DIMETHYL SULFOXIDE | C2H6OS | DMS |
| CA | CALCIUM ION | Ca | CA |
| CL | CHLORIDE ION | Cl | Cl |
| NA | SODIUM ION | Na | NA |
Табл.2 Малые молекулы в записи белка.
Рис.3 Белковое окружение лиганда UYW.