Мини обзор на бактерию Citrobacter tructae

1. Введение: Таксономическая принадлежность бактерии:

домен Bacteria тип Pseudomonadota класс Gammaproteobacteria порядок Enterobacterales семейство Enterobacteriaceae род Citrobacter вид citrobacter tructae

Это грам-отрицательная бактерия[1], Разнообразные виды Citrobacter встречаются в различных средах, таких как вода и почва, а также присутствуют в микробиоте кишечника животных, например, в кишечнике человека [2,3]. Филогенетический анализ нескольких генов домашнего хозяйства обычно проводится для точного выделения и идентификации бактерий рода Citrobacter[4].

2. Материалы и методы

Для анализа данных использовались google sheets команда СЧЁТЕСЛИМН. Информация о бактерии была взята с сайта Национального Центра Биотехнологической Информации NCBI была скачана таблица особенностей генома

3. Результаты

Данная таблица демонстрирует число генов белков и различных РНК в исследуемой бактерии.

Примечательно, что в таблице встречается транспортно-матричная РНК, которая встречается у бактерий и во многих органеллах [5]. Это небольшая РНК длиной от 260 до 430 нуклеотидов, которая участвует в высвобождении рибосом, «застрявших» во время трансляции проблемных участков мРНК, а также участвует в разрушении получившихся в ходе неполной трансляции дефектных пептидов - этот процесс называется транс-трансляция [6].

4. связь между количеством и длиной белка.

Рис.1

Рисунок 1-гистограмма длин белков.

Из гистограммы видно, что чаще всего встречаются белки с длинной в 200-300 аминокислотных остатков. Далее, по мере увеличения длины белков происходит уменьшение их количества, самые длинные белки у данной бактерии - 1200-1300 аминокислотных остатков, таких белков только малая часть от общего количества.

6. Вывод

Из гистограммы видно, что чаще всего встречаются белки с длинной в 200-300 аминокислотных остатков. Далее, по мере увеличения длины белков происходит уменьшение их количества, самые длинные белки у данной бактерии - 1200-1300 аминокислотных остатков, таких белков только малая часть от общего количества.