На главную
Седьмой семестр
Рассеяние на кристалле, разрешение гармоники, разрешение структуры, фазовая проблема
1. Информация о гомологах 1WPN, полученная с помощью BLAST
Custom Report.xls
2. Краткое описание белка 1WPN
a. Главный биологический результат статьи состоит в том, что были получены 3 новых структуры неорганических пирофосфатаз II типа (1 из Streptococcus gordonii, 2 из Bacillus subtilis), и на основании всех имеющихся структур было объяснено, почему фермент активируется при связывании ионов Mn2+ Co2+ и ингибируется при связывании иона Zn2+
b. Разрешение структуры: 1,30 A
c. Фазовая проблема решена методом молекулярного замещения
d. 102851 структурных факторов
e. R-фактор = 0.14025 и R-free фактор = 0.16648
f. Источники: статья,PDB файл, EDS
g. Выравнивание полной последовательности белка с последовательностью из pdb-файла:
Структура содержит только часть бековых цепей (2-188 а.о.), то есть только Pfam-домен DHH (см. Второй семестр).
© Червонцева, 2012